MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidaminococcus fermentans DSM 20731 chromosome

Total Repeats: 51164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013740	GCC	2	6	154238	154243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047516
3502	NC_013740	GGAACA	2	12	154244	154255	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	284047516
3503	NC_013740	CAGC	2	8	154324	154331	25 %	0 %	25 %	50 %	284047516
3504	NC_013740	CTG	2	6	154379	154384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047516
3505	NC_013740	A	6	6	154403	154408	100 %	0 %	0 %	0 %	284047516
3506	NC_013740	GGT	2	6	154417	154422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047516
3507	NC_013740	CGGA	2	8	154461	154468	25 %	0 %	50 %	25 %	284047516
3508	NC_013740	TC	3	6	154472	154477	0 %	50 %	0 %	50 %	284047516
3509	NC_013740	GAA	2	6	154498	154503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047516
3510	NC_013740	CCT	2	6	154543	154548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047516
3511	NC_013740	ATG	2	6	154571	154576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047516
3512	NC_013740	AGG	2	6	154593	154598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047516
3513	NC_013740	GAA	2	6	154655	154660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047516
3514	NC_013740	GCCG	2	8	154709	154716	0 %	0 %	50 %	50 %	284047516
3515	NC_013740	GAA	2	6	154742	154747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047516
3516	NC_013740	TTC	2	6	154769	154774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047516
3517	NC_013740	A	6	6	154784	154789	100 %	0 %	0 %	0 %	284047516
3518	NC_013740	GCG	2	6	154911	154916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047516
3519	NC_013740	GCG	2	6	154958	154963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047516
3520	NC_013740	TGA	2	6	154969	154974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047516
3521	NC_013740	CAGC	2	8	155005	155012	25 %	0 %	25 %	50 %	284047516
3522	NC_013740	TGA	2	6	155121	155126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047516
3523	NC_013740	CGG	2	6	155135	155140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047516
3524	NC_013740	GAAA	2	8	155176	155183	75 %	0 %	25 %	0 %	284047516
3525	NC_013740	GGA	2	6	155227	155232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047516
3526	NC_013740	CTC	2	6	155288	155293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047516
3527	NC_013740	ATT	2	6	155301	155306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284047516
3528	NC_013740	CAG	2	6	155327	155332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047516
3529	NC_013740	ATC	2	6	155336	155341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047516
3530	NC_013740	GATACG	2	12	155372	155383	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	284047516
3531	NC_013740	CCGGG	2	10	155389	155398	0 %	0 %	60 %	40 %	284047516
3532	NC_013740	A	6	6	155399	155404	100 %	0 %	0 %	0 %	284047516
3533	NC_013740	AGAA	2	8	155481	155488	75 %	0 %	25 %	0 %	284047517
3534	NC_013740	G	7	7	155552	155558	0 %	0 %	100 %	0 %	284047517
3535	NC_013740	GCA	2	6	155595	155600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047517
3536	NC_013740	ATG	2	6	155622	155627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047517
3537	NC_013740	CCGG	2	8	155644	155651	0 %	0 %	50 %	50 %	284047517
3538	NC_013740	CTC	2	6	155657	155662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047517
3539	NC_013740	GAAC	2	8	155680	155687	50 %	0 %	25 %	25 %	284047517
3540	NC_013740	CAA	2	6	155743	155748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284047517
3541	NC_013740	ACT	2	6	155880	155885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047517
3542	NC_013740	CCGG	2	8	155971	155978	0 %	0 %	50 %	50 %	284047517
3543	NC_013740	TGC	2	6	156000	156005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047517
3544	NC_013740	TGA	2	6	156054	156059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047517
3545	NC_013740	CGG	2	6	156090	156095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047517
3546	NC_013740	CTTC	2	8	156096	156103	0 %	50 %	0 %	50 %	284047517
3547	NC_013740	GTCC	2	8	156154	156161	0 %	25 %	25 %	50 %	284047517
3548	NC_013740	ACA	2	6	156352	156357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284047518
3549	NC_013740	GAA	2	6	156408	156413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047518
3550	NC_013740	AAG	2	6	156417	156422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047518
3551	NC_013740	A	6	6	156535	156540	100 %	0 %	0 %	0 %	284047518
3552	NC_013740	A	6	6	156585	156590	100 %	0 %	0 %	0 %	284047518
3553	NC_013740	ACCC	2	8	156710	156717	25 %	0 %	0 %	75 %	284047518
3554	NC_013740	CTA	2	6	156812	156817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047518
3555	NC_013740	GA	3	6	157048	157053	50 %	0 %	50 %	0 %	284047518
3556	NC_013740	GCA	2	6	157154	157159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047518
3557	NC_013740	ATG	2	6	157210	157215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047518
3558	NC_013740	TGG	2	6	157228	157233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047518
3559	NC_013740	GCC	2	6	157314	157319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047518
3560	NC_013740	GAACA	2	10	157350	157359	60 %	0 %	20 %	20 %	284047518
3561	NC_013740	CCG	2	6	157406	157411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047518
3562	NC_013740	CCG	2	6	157427	157432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047518
3563	NC_013740	GCC	2	6	157503	157508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047518
3564	NC_013740	CAG	2	6	157524	157529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047518
3565	NC_013740	GTG	3	9	157542	157550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047518
3566	NC_013740	CCG	2	6	157650	157655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3567	NC_013740	TTTC	2	8	157670	157677	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3568	NC_013740	TGG	2	6	157776	157781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_013740	CTC	2	6	157800	157805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3570	NC_013740	TCT	2	6	157854	157859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_013740	GTA	2	6	157864	157869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_013740	GAAC	2	8	157952	157959	50 %	0 %	25 %	25 %	284047519
3573	NC_013740	T	6	6	157964	157969	0 %	100 %	0 %	0 %	284047519
3574	NC_013740	CTC	2	6	158017	158022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047519
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3592	NC_013740	GAA	2	6	159069	159074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047519
3593	NC_013740	GGA	2	6	159080	159085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047519
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3595	NC_013740	A	6	6	159131	159136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_013740	T	6	6	159153	159158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_013740	TA	3	6	159181	159186	50 %	50 %	0 %	0 %	284047520
3598	NC_013740	CGGT	2	8	159276	159283	0 %	25 %	50 %	25 %	284047520
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3605	NC_013740	GCC	2	6	159615	159620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047520
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3607	NC_013740	GGTG	2	8	159670	159677	0 %	25 %	75 %	0 %	284047520
3608	NC_013740	TGGC	2	8	159681	159688	0 %	25 %	50 %	25 %	284047520
3609	NC_013740	CGG	2	6	159691	159696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047520
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3612	NC_013740	CCCGG	2	10	159755	159764	0 %	0 %	40 %	60 %	284047520
3613	NC_013740	GAAAT	2	10	159774	159783	60 %	20 %	20 %	0 %	284047520
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3619	NC_013740	AGCC	2	8	160029	160036	25 %	0 %	25 %	50 %	284047520
3620	NC_013740	GCA	2	6	160054	160059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047520
3621	NC_013740	TCCGG	2	10	160195	160204	0 %	20 %	40 %	40 %	284047520
3622	NC_013740	TCCC	2	8	160247	160254	0 %	25 %	0 %	75 %	284047520
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3624	NC_013740	TAT	2	6	160366	160371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3991	NC_013740	CAT	3	9	176548	176556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047536
3992	NC_013740	CTG	2	6	176600	176605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047536
3993	NC_013740	GCG	2	6	176627	176632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047536
3994	NC_013740	CCTG	2	8	176655	176662	0 %	25 %	25 %	50 %	284047536
3995	NC_013740	GCC	2	6	176684	176689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047536
3996	NC_013740	CCA	3	9	176706	176714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047536
3997	NC_013740	ATC	2	6	176878	176883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047537
3998	NC_013740	CCCG	2	8	176884	176891	0 %	0 %	25 %	75 %	284047537
3999	NC_013740	ACC	2	6	176950	176955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047537
4000	NC_013740	CAT	2	6	176982	176987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047537

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